Августин Пфлегер учился в Нюрнберге у Иоганна Эразмуса Киндерманна, одного из ведущих композиторов нюрнбергской школы первой половины XVII века. Обучение проходило в 1650‑е годы, когда Пфлегер, родившийся в 1635 году, формировался как музыкант.
Киндерманн, будучи признанным органистом, композитором и известным педагогом, оказал значительное влияние на музыкальное развитие Пфлегера, что заложило основу его дальнейшей деятельности как придворного музыканта и капельмейстера.