Франц Шоберлехнер обучался игре на фортепиано у Иоганна Непомука Гуммеля в Вене, где получил основную часть своей ранней музыкальной подготовки. Гуммель был его главным наставником по фортепиано и оказал значительное влияние на формирование его исполнительского стиля.
Учёба у Гуммеля дала результат уже в ранние годы: в 1809 году, будучи двенадцатилетним, Шоберлехнер исполнил на премьере Второй фортепианный концерт Гуммеля, написанный специально для него. Это выступление стало одним из первых значительных публичных успехов юного пианиста и показало тесную творческую связь между учителем и учеником.