В церкви св. Себальда Пахельбель получил первые серьёзные уроки музыки у Георга Веккера, занимавшего должность органиста и являвшегося одним из ключевых представителей нюрнбергской музыкальной традиции.
Под руководством Веккера он изучал игру на клавишных инструментах и основы композиции, впитывая художественные принципы, восходящие к школе Киндермана. Обучение у Веккера стало важным этапом формирования Пахельбеля как органиста и композитора, а впоследствии он занял место своего учителя в той же церкви.