Иоганн Шейн учился у Рожьера Михаэля в Дрездене, где с 1599 года был певчим придворной капеллы. В это время Михаэль, занимавший должность придворного капельмейстера курфюрстской капеллы, обучал его музыке и способствовал развитию его вокального таланта.
Под руководством Рожьера Михаэля Шейн получил первые систематические знания в области музыкальной теории и практики, что заложило основу его дальнейшего становления как композитора раннего немецкого барокко.
