Иоганн Шелле в детские годы, с 1655 по 1657 год, был певчим в саксонской капелле в Дрездене и в этот период обучался у Генриха Шютца, крупнейшего немецкого композитора раннего барокко и придворного капельмейстера. Шелле назывался учеником Шютца, и именно под его руководством получил первые серьёзные музыкальные знания.
Связь между ними продолжилась и после окончания первоначального обучения: по рекомендации Генриха Шютца в 1657 году Шелле был направлен певчим в Вольфенбюттель, что подчёркивает доверие и поддержку со стороны его учителя и влияние Шютца на дальнейшую музыкальную карьеру Шелле.
