Йозеф Дессауэр изучал композицию у чешского композитора и педагога Вацлава Яна Томашека в Пражской консерватории. Томашек оказал значительное влияние на его музыкальное формирование и познакомил молодого композитора с Франтишеком Палацким, с которым Дессауэр впоследствии подружился.
Обучение у Томашека происходило в период, когда тот создал в Праге собственную музыкальную школу, ставшую одной из ведущих в городе. Дессауэр принадлежал к числу его учеников, получивших фундаментальную подготовку, благодаря которой он смог развить свои композиторские способности и впоследствии добиться признания, в частности в жанре песенного творчества.