Анатолій Скрипай навчався під керівництвом Семена Бендицького, починаючи з уроків у музичній школі, згодом у Саратовському музичному училищі та Саратовській державній консерваторії. У 1968 році він з відзнакою закінчив консерваторію по класу Бендицького.
Зустріч із педагогом відіграла визначальну роль у виборі творчого шляху музиканта: Бендицький розпізнав обдарованість учня та взяв його до свого класу, де Скрипай пройшов етапи формування виконавської майстерності. Анатолій Скрипай є одним із представників піаністичної школи, створеної Семеном Бендицьким.