Джованні Баттіста Мартіні навчався композиції та, зокрема, церковної музики під керівництвом Джакомо Антоніо Перті, капельмейстера собору Святого Петра та кафедрального собору Сан-Петроніо в Болоньї. Навчання відбувалося в Болоньї у першій половині XVIII століття, коли юний Мартіні здобував музичну освіту після початкових уроків у свого батька та інших педагогів.
Перті мав значний вплив на формування Мартіні як музиканта й теоретика, адже саме він передавав традиції італійської церковної музики та майстерності контрапункту, які пізніше стали основою творчого й педагогічного стилю Мартіні. У біографічних джерелах підкреслюється, що Перті був одним із найважливіших наставників Мартіні в його молоді роки та допоміг сформувати його професійний шлях.