Джироламо Дірута навчався у Клаудіо Меруло після переїзду до Венеції близько 1578 року, де він познайомився з Меруло та іншими провідними музикантами Венеціанської школи. Джерела вказують, що Дірута, ймовірно, був учнем Меруло, адже саме в цей період він переймав органну техніку та принципи композиції від видатного майстра.
Клаудіо Меруло у рекомендаційному листі, датованому, імовірно, 1580-ми роками, називав Діруту одним зі своїх найкращих учнів, що підтверджує існування тісних педагогічних взаємин між ними. Крім того, Дірута у вступі до свого трактату «Il Transilvano» (1593) високо оцінював настанови, отримані саме від Меруло, що підкреслює вплив учителя на його теоретичну та виконавську майстерність.