Йоганн Крістіан був наймолодшим сином Йоганна Себастьяна Баха та Анни Магдалени, народженим у Лейпцигу в 1735 році. Батько став його першим учителем музики, давши початкову підготовку, яка згодом визначила шлях молодшого Баха. Хоча навчання в родині тривало недовго через погіршення здоров’я Йоганна Себастьяна у останні роки життя, саме він заклав основи музичної освіченості сина й передав йому традиції бахівської школи.
Після смерті батька Йоганн Крістіан продовжив музичну освіту під опікою свого зведеного брата Карла Філіппа Емануеля, але ранній вплив Йоганна Себастьяна залишив відчутний слід у його становленні. Незважаючи на подальший різкий відхід молодшого Баха від естетики бароко, він зберігав шанобливе ставлення до батька як до джерела свого першого музичного досвіду, а пізніші порівняння сучасників неодноразово підкреслювали глибоку різницю між їхніми стилями, що символізувало зміну епох у межах однієї родини.
