Зигфрид Вагнер був сином композитора Рихарда Вагнера та його другої дружини Козіми. Він був третьою дитиною в родині.
У своїй творчості Зигфрид наслідував приклад батька, самостійно створюючи лібрето до своїх опер. Протягом 1908—1930 років він обіймав посаду керівника вагнерівського фестивалю в Байройті. Також відомо, що музику Зигфриду, як сину Рихарда Вагнера, викладав Енгельберт Гумпердінк.