Володимир Нільсен був учнем Ісая Браудо в Ленінградській (Петроградській) консерваторії. У період з 1927 по 1931 рік він навчався під керівництвом Браудо в класі органа.
Ісай Браудо згадується як один із основних наставників Нільсена в його становленні як органіста. У свою чергу, Володимир Нільсен входить до переліку видатних виконавців, яких виховав професор Браудо за роки своєї викладацької діяльності.